近日,浙师大生化学院邵勇研究员课题组以“Switching G-Quadruplex to parallel duplex by molecular rotor clustering”为题在Oxford University Press旗下的Nucleic Acids Research上发表研究成果。Nucleic Acids Research是国际核酸研究领域最具影响力的刊物,最新影响因子为19.16。
G-Quadruplex(G4)是近年来最受关注的非经典核酸结构,其稳定性及结构开关转换在疾病发生发展、靶向药物设计、新型传感器构建、生物催化等方面具有重要研究价值。目前国际上研究较多的是发展小分子配体(或药物前体),与G4结合多为单分子结合,以稳定G4结构,或使G4从一种构象转变为另一种构象。最近也意识到使G4转变为非G4结构的开关策略也具有同等的重要性。然而单分子结合很难实现这种G4结构开关,尤其在体液条件下如何实现开关依然面临挑战。
为了克服单分子结合难于开关G4结构的困难,该课题组首次提出了clustering结合方式实现G4到平行双链(psDNA)的结构开关。由于psDNA中含有多个小分子配体的结合位点,因此多分子的clustering结合使psDNA结构的稳定性高于G4结构,从而实现G4到psDNA的结构开关。该课题组发现具有分子转子(molecular rotor,MR)性能的配体在clustering结合模式下能使G4结构转变为psDNA。MR配体具有很好的构象灵活性及荧光调控性能,在实现G4到psDNA结构开关的同时,其荧光发射也显著增强。此外,通过设计高结合强度的MR配体,甚至可实现具有高稳定性G4的结构开关,这为该方法的普适化应用提供了范例。MR配体的clustering结合实现了KRAS及c-Myc原癌基因转录起始位点及核酸酶高敏感区域G4结构的开关。该研究工作也预示着可通过这种结构转变实现RNA(如microRNA)的功能调控。
生化学院化学2020级博士研究生许秋达同学为论文的第一作者,邵勇研究员为论文通讯作者,浙江师范大学为论文唯一完成单位。据悉,这是浙师大首次以通讯单位在该刊物上发表研究成果。
上述研究工作得到了国家自然科学基金、浙江省创新领军人才项目、浙江省自然科学基金、以及浙江师范大学的经费支持。